菏泽市中医医院是全市唯一一所三级甲等中医医院，是山东中医药大学、菏泽医专、山东高等中医药专科学校、曲阜中医药学校等教学医院，担负着全市中医药的医疗、教学、科研、预防、康复等责任，拥有卫生技术人员489人，正高级职称9人，副高级职称53人，中级职称102人，初级职称123人，医学博士3人，硕士研究生37人。2010年下半年，我院一次引进了3名医学博士和28名医学硕士。

我院地理位置优越，西邻风景秀丽的赵王河，南邻洙水河、市委市政府，北邻晋冀鲁豫纪念馆、菏泽大剧院、演武楼、图书馆、牡丹广场、胜利广场，交通便利，坐落菏泽市政治、经济、文化中心。科室设置齐全，设有内科、外科、妇产、儿科、针灸推拿、中风、耳鼻喉、眼科、口腔、皮肤、医疗美容、痔瘘、碎石、肝病、糖尿病、肿瘤、ICU、放射、特检、检验等临床医技科室。专科优势较为突出，在6个市级重点专科的基础上，力争再创省级重点专科建设单位3个。

四万多平方米的一期门诊病房综合大楼今年年底主体工程完工，明年年底全部竣工并交付使用。新楼建成后，病床由原来的300余张扩展到800余张，统一安装高标准呼吸系统，集中供氧，中央空调，配备先进的病床及配套设施，同时配备相应的先进检查、治疗设备，有高、中、低档病房，充分满足不同患者需求。二期工程建成后，医疗用房达6万多平方米，床位达1200余张，即成为菏泽市城区东部具有名老中医工作室、国医堂、制剂中心、康复中心、未病治疗中心等中医特色的综合性现代化医院。

医院现有省名老中医专家1人，菏泽市专业技术拔尖人才2人，5项科研成果获省、市科技进步奖;发表国家、省级论文55篇。

现为菏泽市城镇职工医保定点医院和开发区新农合定点医院，起着全市中医药事业的龙头带动作用，曾被评为淮海经济区优秀医院，科技卫生“三下乡”先进集体，被省卫生厅、市卫生局评定为职业道德建设先进单位。

医院拥有美国GE公司大型螺旋CT、数字电视胃肠机、脑多普勒、彩色超诊断仪、全自动生化分析仪、体外震动碎石机、三维多功能牵引床等设备。